A base genética zero, é determinada pelos valores das DEPs dos animais fundadores na avaliação genética. Animais fundadores são aqueles sem o pedigree de um ou de ambos os pais na análise. Não é, portanto, a média de todos os animais analisados. Esta base genética poderia mudar em análises posteriores se novos animais com pais desconhecidos fossem acrescentado na análise.

Como a população dos rebanhos participantes do PMGRN encontra-se em franca expansão, adotou-se a base implícita no procedimento de avaliação, que considera a média das DEPs de todos os animais dos quais não se conhecem informações dos antecessores, como sendo zero. Dessa maneira, a base fica constituída principalmente pelos reprodutores mais antigos, os quais, de fato, representam parte da origem genética da população atual da raça.